Die theoretische Hylogetik beschäftigt sich mit dem Problem der Rekonstruktion der vergangenen Evolutionsgeschichte rezenter Organismen aus heutigen molekularen Daten wie der DNA. Es besteht ein anhaltendes Interesse an der Weiterentwicklung der Mathematik, die den computergestützten phylogenetischen Methoden zugrunde liegt.
Zeitschriften mit Bezug zu Theoretical Phylogenetics Journal of Phylogenetics & Evolutionary Biology, Journal of Proteomics & Bioinformatics, Molecular Systematics and Phylogenetics, Current Advances in Molecular Phylogenetics, Evolutionary Bioinformatics, Journal of Evolution Equation, Arthropod Systematics & Phylogeny, Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular und Entwicklungsentwicklung
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