Die Diagnose pathogener Mikroorganismen erfolgt durch direkte Untersuchung und Techniken. Immunfluoreszenz, Immunperoxidase-Färbung und andere Immunoassays können spezifische mikrobielle Antigene nachweisen. Genetische Sonden identifizieren gattungs- oder artspezifische DNA- oder RNA-Sequenzen.
Kultur: Nichtselektive (nichthemmende) Medien und selektive Medien enthalten hemmende Substanzen.
Serodiagnose: Der steigende Titer spezifischer IgG-Antikörper oder das Vorhandensein spezifischer IgM-Antikörper.