Zeitschrift für Forensische Medizin

Entwicklung molekularer Marker in medizinischen Salvia-Arten

Abstract

Yang Liu

Wir verwendeten die Illumina Hiseq 2500-Technologie, um die Chloroplastengenome von Salvia bowleyana , S. splendens und S. officinalis zu sequenzieren , um ihre evolutionären Beziehungen gründlich zu ermitteln und molekulare Marker für die Artenklassifizierung zu erstellen. S. bowleyana , S. splendens und S. officinalis hatten alle Chloroplastengenome mit einer Länge von 151.387, 150.604 bzw. 151.163 Basenpaaren. Die IR-Bereiche enthielten die sechs Gene ndhB, rpl2, rpl23, rps7, rps12 und ycf2. Es gibt 29 Tandemwiederholungen, 35 einfache Sequenzwiederholungen, 24 einfache Sequenzwiederholungen und 47, 49, 40 eingestreute Wiederholungen in den Chloroplastengenomen von S. bowleyana , S. splendens und S. officinalis . Die 23 Salvia -Arten konnten anhand der drei unterschiedlichen intergenischen Sequenzen (IGS) rps16-trnQ-UUG, trnL-UAA-trnF-GAA und trnM-CAU-atpE unterschieden werden. Durch genetische Distanzanalyse konnten insgesamt 91 intergenische Spacer-Sequenzen identifiziert werden. Die beiden spezifischen IGS-Bereiche (ycf3-trnS-GGA und trnG-GCC-trnM-CAU) weisen die höchsten K2p-Werte unter den drei untersuchten Salvia- Arten auf. Der phylogenetische Baum zeigte auch, dass die 23 Salvia -Arten eine monophyletische Gruppe bildeten. Die Entdeckung von zwei Sätzen gattungsspezifischer DNA-Barcode-Primer. Die Erkenntnisse werden eine solide Grundlage für das Verständnis der phylogenetischen Klassifizierung der drei Salvia -Arten bilden. Darüber hinaus können die einzigartigen intergenischen Regionen die Möglichkeit bieten, Salvia -Arten sowohl phänotypisch als auch anhand der Differenzierung von Gensegmenten zu unterscheiden .