Zeitschrift für Blut und Lymphe

Vergleich transkriptomischer Veränderungen bei jüngeren und älteren Patienten mit multiplem Myelom anhand der RNA-Sequenzdaten der MMRF-CoMMpass-Studie

Abstract

Merve Keskin

Hintergrund: Altersbedingte Unterschiede beim Multiplen Myelom (MM) werden im klinischen und genomischen Kontext untersucht, Transkriptomveränderungen wurden jedoch noch nicht bestimmt. Ziel dieser Studie ist es, die Gene zu identifizieren, die bei jungen und alten Patientengruppen unterschiedlich exprimiert werden, und die Beziehung dieser Gene zu biologischen Prozessen und den verwendbaren Medikamenten zu untersuchen.

Methoden: Die RNA-Sequenzdaten der MMRF CoMMpass-Kohorte (n = 634) wurden verwendet, um differenziell exprimierte Gene bei jungen und alten Patienten zu analysieren. Die Anreicherungsanalyse des GO-Terms und des KEGG-Gensatzes wurde mithilfe von R-Paketen durchgeführt. Arzneimittel-Gen-Interaktionen wurden mithilfe von DGIdb erkannt.

Ergebnisse: Insgesamt wurden 523 Gene (366 hochreguliert, 157 herunterreguliert) bei jungen Patienten differenziell exprimiert (p<0,05). Insgesamt wurden 220 GO-Begriffe angereichert, die sich hauptsächlich auf Immunregulationswege beziehen. Der Gensatz „Zytokin-Zytokin-Rezeptor-Interaktion“ wurde in KEGG GSEA angereichert. Zu den Genen mit den höchsten Expressionsunterschieden zählen Gene, die an der Immunregulation beteiligt sind (FCGR1A, FCER1G, TLR2), bekannte proto-onkogene Gene (BCL2, FGR) und Gene, die auf ihren Zusammenhang mit verschiedenen Krebsarten untersucht werden (RGL4, MT-RNR1, ETS2, ENPP3, FUT7, NTNG2, PRAM1). Es wurden Medikamente identifiziert, die mit den von diesen Genen beeinflussten Signalwegen in Zusammenhang stehen.

Schlussfolgerung: Weitere Untersuchungen unterschiedlich exprimierter Gene bei jungen Patienten könnten Aufschluss über neue Behandlungsmöglichkeiten geben.